鞭毛菌類

Mastigomycota）または真菌門の1亜門（鞭毛菌亜門 Mastigomycotina）として扱われていた。ツボカビ類、サカゲツボカビ類、卵菌類などが含まれるが、これらは互いに近縁ではないと考えられるようになり、21世紀現在では鞭毛菌類は分類群として扱われることはない。ただし、これらの生物を示す一般名として鞭毛菌類が用いられることがある。